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公元4世纪的埃及，生活在亚历山大城的希帕提娅（蕾切尔·薇姿饰）是埃及杰出的女数学家、占星家、哲学家，她致力于古代文明智慧的收集整理，却被当时逐渐兴起的基督教视为异教徒、眼中钉。希帕提娅的奴隶达乌斯（麦克思·明格拉饰）一方面爱着自己的女主人，另一方面也希望加入基督教换取自由。然而这两者如水火一般不可交融，让他陷入深深的矛盾挣扎中，然而希帕提娅最终还是被基督教暴民害死。