光和2年。世界以重组的超合集国为中心，讴歌着和平的每一天。但是，和平突然要宣告结束。以面具男ZERO的身份，与娜娜莉同行去难民营慰问的朱雀败给了谜之Knightmare Frame。然后，二人被掳走了。收到修奈杰尔的密令，潜入“战士之国”吉尔克斯坦王国的卡莲、洛伊德、咲世子遭到了谜之GEASS使用者的袭击。而且，被袭击者称为“原教主大人”的C.C.也在那里。以曾经击败过神圣不列颠尼亚帝国大军的无敌王国为舞台，人们所描绘出来的愿望，是希望还是绝望？而最终知道了GEASS之情的吉尔克斯坦王宫众人，以及C.C.的想法究竟是什么——
