1520年，法兰西斯科·皮萨罗发现秘鲁的十年前，印加帝国东边遭到一群图比那邦斯（Tupinambas）人组成的乌合之众扰境。这些印第安人来自巴西，带头的首领是一名欧洲人，名叫阿莱久·加尔席亚（Alejo Garcia）。太阳之子最后终于遏止他们的攻势，从此他们在山脚下定居下来，自称为希里加诺人（Chiriguanos）。

人们传言阿莱久·加尔席亚为葡萄牙弗朗德勒人的后裔，曾经掳获了一名印加公主陪伴身侧，两人从此消失在东方。而据说这名男子有一双宛如陶瓷色泽般湛蓝的眼睛……

曼科救回被俘的儿子帝图·库吉后，隐遁在维尔卡邦巴森林中过了好几年。直到1544年，曼科在维科，遭到七名为他收容的亚勒马格罗派分子所杀。后者借由卑劣的暗杀手段，想搏得巩萨洛·皮萨罗的原谅。

1543年，保禄以克里斯托博（Cristobal）为名，在家族中最重要的贵族见证下受封为王。又1545年，他也受封为末等的西班牙贵族。印加阴郁的史诗中，描写保禄为少数“自然死亡”的国王之一。他死于1549年。

艾南多·皮萨罗在西班牙遭囚禁近二十年。他被囚禁在位于麦地那·德·坎波（Medina del Campo）的拉·蒙塔（La Mota）城堡，并由于他娶了兄长法兰西斯科的女儿，从那时起，他用尽心力、毫不松懈地管理皮萨罗家族广大却无用的财富。1561年他获得释放，在家乡特鲁希略（Trujillo）建了一座皇宫。1578年，几乎双眼失明的他殁于此，享年高达七十一岁。

巩萨洛·皮萨罗始终保持着一贯的风格，从未放弃自己的雄心壮志，他一生的命运似乎也没亏待他。1544年，他自封为秘鲁总督，公然与西班牙王庭对抗。他在将近四年的统治中，不停地在对手的阵营散播恐怖行径，特别是倚靠他的左右手法兰西斯科·德·卡尔巴杰（Francisco de Carbajal）将军。此人素有“印第安高地的恶魔”之封号。1548年，巩萨洛终于被皇室打败，在战场上遭人就地斩首示众。

曼科的继位者仍于维尔卡邦巴反抗西班牙的统治，其间游击行动与以和平为代价的谈判轮番上演。直到1572年，隐居森林的印加国王图帕·亚马鲁（Tupac Amaru）被抓。法兰西斯科·托雷多（Francisco Toledo）下令将这位印加帝国的末代皇帝遣送至库斯科，并在这个古老城都的阿荷蒙（Armes）广场上斩首示众。

最后一位印加国王遭人斩首后，其头颅不仅未见腐朽，反而随着时间更显光彩焕发，因此成为大家日渐笃信的膜拜对象。直至今日，神秘的传说仍预言着，他的头颅终将寻回当日遭人砍断的躯体，届时，亦将是印加国王返回之时。